1949年6月25日,上海市军管会正式接管同济大学。由于革命形势的发展,原来各校教职员工分散的组织形式已不能够适应新的要求,上海市高教联号召全市大专学校组织员工会(全称“大专学校教职员团体联合会”),然后过渡到“高等教育工作者联合会”,由团体会员过渡到个人会员。
当时学校教职员工中有教授联谊会、讲师助教会、职员会和工友会,四个团体协商成立员工会筹备会,各团体产生筹备委员5人,附职附中各产生筹备委员会1人。
1949年12月5日,在北四川路底我校总办公处举行工会筹备会成立大会,同济大学员工会筹备会成立,筹备会委员22人。筹备会主席团由杨烈、瞿立林、程宗霖、陈介人4人组成。
1949年底,为配合上海市总工会的筹备工作,在上海市高教处的号召下,筹备直接成立工会。
1950年4月1日,工会开始发展会员,首批76人入会。
1950年5月20日,举行了工会成立典礼,宣布上海市教育工作者工会同济大学委员会正式成立。
2012年3月,九届二次教代会上,裴钢校长作《锐意改革创新,不断追求卓越,开创同济大学改革发展新局面》的学校工作报告。代表们听取、审议学校行政工作报告、财务情况报告、提案工作报告、工会财务工作报告、经费审查委员会年度工作报告;
2013年1月,九届三次教代会上,裴钢校长作学校工作报告。代表们听取、审议学校行政工作报告、财务情况报告、提案工作报告、工会财务工作报告、经费审查委员会年度工作报告;表决通过《同济大学教职工代表大会实施办法》(修订)。
2014年1月,九届四次教代会上,裴钢校长作学校工作报告。代表们听取、审议学校行政工作报告、财务情况报告、提案工作报告、工会财务工作报告、经费审查委员会年度工作报告;讨论《同济大学科研成果奖励办法(修订稿)》、《同济大学科研绩效计算办法(修订稿)》、《同济大学人文社会科学成果奖励条例(讨论稿)》。
2015年1月,九届五次教代会上,裴钢校长作学校工作报告。代表们听取、审议学校行政工作报告、财务情况报告、提案工作报告、工会财务工作报告、经费审查委员会年度工作报告;讨论《同济大学科研项目过程管理实施流程》(征求意见稿)。
2021年1月,第十一届第一次教职工代表大会、第二十届第一次工会会员代表大会召开。选举产生了同济大学第十一届教职工代表大会执行委员会;选举产生了同济大学第二十届工会委员会和工会经济审查委员会,选举吴广明为同济大学工会主席。代表们听取、审议学校工作报告、财务情况报告、工会工作报告、提案工作报告、工会财务及经费审查工作报告;讨论了《同济大学“十四五”发展规划纲要(征求意见稿)》,表决通过了《同济大学教职工代表大会实施办法(修订)》《同济大学工会会员代表大会实施办法(试行)》。